天正11(1583)年に前田利家が金沢城に入ると、その直後から本格的な城づくりが始められ、高山右近を招いて築城の指導を仰いだと伝えらる。この頃に西丁口から尾坂口へと大手が変更された。当時は城内に重臣たちの屋敷があり広い城ではなかった。
慶長7(1602)年に落雷により天守閣が焼失した後は天守閣は再建されることはなく、本丸には三階櫓、二の丸には御殿が建てられた。
寛永8(1631)年の火災の後は、二の丸の拡大や辰巳用水の通水などにより城のし、武家屋敷も城外へと出され、。内堀を掘り、土を掻き上げて各曲輪が区画されていった。
宝暦9(1759)年の火災で城のほとんどが焼失し、実用性を重んじて二の丸を中心とした整備が行われ、本丸の櫓は再建されなかった。現存する石川門は、この後、天明8(1788)年に再建された。
文化5(1808)年、二の丸火災の後再建され明治14(1881)年の火災で焼失した菱櫓・五十間長屋・橋爪門続櫓は平成13年に復元され、安政の頃の景観を再現した。